O fundo documental, que cobre as áreas científicas da Universidade Atlântica, é constituído por cerca de 10000 documentos em suporte papel e digital que resulta da política de aquisições da Universidade e de doações realizadas por editoras e por alguns professores da Universidade.

Destaca-se o espólio do Professor Doutor Afonso de Barros (1º Reitor da Universidade Atlântica) do qual constam cerca de 1500 títulos, alguns dos quais manuscritos originais.